Ведущий разработчик Assassin's Creed Shadows уверяет игроков, что выбор одного главного героя не повлияет на их опыт. В игре участвуют два игровых персонажа: Naoe, женский шиноби и Ясуке, исторический африканский самурай, чье включение вызвало предварительное обсуждение.
Возникла опасения, что сосредоточение внимания на одном персонаже может привести к отсутствию важных моментов сюжета или игрового процесса. Креативный директор Джонатан Дюмон рассмотрел эти проблемы, описывая свой собственный сбалансированный подход: он обычно играет 3-5 часов с одним персонажем, прежде чем переходить на другой на 2-3 часа.
Тем не менее, Дюмонт пояснил, что игроки не будут серьезно невыполнены, предпочитая одного персонажа. В то время как каждый главный герой может похвастаться уникальными вступительными последовательностями и личными сюжетными линиями, повествование игры адаптируется к выбору игрока. Он призывает игроков расставлять приоритеты в своем предпочтительном характере:
«Основной игровой процесс остается последовательным, независимо от вашего выбора. Вы не пропустите основные элементы сюжета. У каждого персонажа есть свое введение и квесты, но общий опыт предназначен для того, чтобы быть гибким. Играйте как ваш любимый; история будет приспособиться».