Lo sviluppatore principale di Assassin Creed Shadows assicura ai giocatori che la scelta di un singolo protagonista non avrà un impatto significativo sulla loro esperienza. Il gioco presenta due personaggi giocabili: Naoe, uno shinobi femminile e Yasuke, uno storico samurai africano, la cui inclusione ha generato discussioni pre-release.
Sono sorse le preoccupazioni che concentrarsi su un personaggio potrebbero portare a punti di trama cruciali o gameplay. Il direttore creativo Jonathan Dumont ha affrontato queste preoccupazioni, descrivendo il suo approccio equilibrato: in genere gioca 3-5 ore con un personaggio prima di passare all'altro per 2-3 ore.
Tuttavia, Dumont ha chiarito che i giocatori non saranno gravemente svantaggiati favorendo un personaggio. Mentre ogni protagonista vanta sequenze di apertura uniche e trame personali, la narrativa del gioco si adatta alla scelta del giocatore. Incoraggia i giocatori a dare la priorità al loro personaggio preferito:
"Il gameplay di base rimane coerente indipendentemente dalla tua scelta. Non perderai i principali elementi della trama. Ogni personaggio ha la propria introduzione e missioni, ma l'esperienza complessiva è progettata per essere flessibile. Gioca come il tuo preferito; la storia si adatterà."
